यह असम के धेमाजी जिले के मुरकोंगसेलेक ब्लॉक में स्थित है

जोनाई में मिशन 1979 में फादर अब्राहम कुट्टियनकल द्वारा शुरू किया गया था। वह जो एक साल के लिए कुमरीकट्टा में सहायक पल्ली पुरोहित के रूप में सेवा कर रहे थे, उन्हें धेमाजी जिले के तहत जोनाई भेजा गया था।

MSFS के आने से दो साल पहले जोनाई कैथोलिक थे। ये वे गारो थे जो अरुणाचल प्रदेश के आदिवासियों की धरती पर काम करने आए थे। फादर इब्राहीम ने उन्हें इकट्ठा किया और रविवार की सभा और प्रार्थना सभा शुरू की। धीरे-धीरे क्षेत्र के कैथोलिक एक साथ आए और एक समुदाय का गठन किया और रविवार की प्रार्थना नियमित रूप से शुरू की।

1979 के मध्य में, तेज़पुर सूबे के विकर जनरल, फादर चेरियन मूलमट्टम को हमारे नए भवन को आशीर्वाद देने और उद्घाटन करने के लिए बुलाया गया था, जबकि अनुविभागीय अधिकारी मुख्य अतिथि थे। स्कूल सेंट फ्रांसिस डी सेल्स को समर्पित था और इसका नाम 'फ्रांसलियन स्कूल' रखा गया था। लेकिन ज्यादातर लोग इसका उच्चारण ठीक से नहीं कर पाते थे और इसलिए उन्होंने इसे 'फ्रेंच स्कूल' कहा था! भले ही स्कूल शैक्षणिक वर्ष के मध्य में शुरू हुआ था, लेकिन 65 छात्रों ने लोअर किंडरगार्टन (एलकेजी) में प्रवेश लिया। इसमें खोगेन मार्डी और दुबई सोरेन शामिल थे। शिक्षकों के पहले बैच में लुसी टौरो, लुसी इमैनुएल और एलिस शामिल थे" (कुट्टियनकल, 2000 पृष्ठ 45)। फादर अब्राहम ने 1983 तक मिशन की सेवा की।

1990-95 के बीच, स्कूल भवन का विस्तार करके अधिक कक्षाओं और खेल के मैदान की आवश्यकता को पूरा किया गया। छात्रों और कर्मचारियों की भलाई के लिए एक पूर्ण विकसित बुक स्टॉल अस्तित्व में आया। सीनियर थेरेसा कुरियन ने सुपीरियर के पद पर रहते हुए बुक स्टॉल चलाने की चुनौती स्वीकार की।

स्कूल की रजत जयंती (1979-2004) 30 अक्टूबर से 1 नवंबर, 2004 तक 'ब्लूम व्हेयर यू आर प्लांटेड' थीम के साथ मनाई गई। साल भर चलने वाले समारोह 25 मार्च 2004 को शुरू हुए और 1 नवंबर 2004 को समाप्त हुए।

फ्रांसेलियन स्कूल के पहले बैच के छात्र जो एचएसएलसी बोर्ड की परीक्षा में शामिल हुए थे, उनका परिणाम शानदार रहा। 15 में से 3 ने प्रथम श्रेणी प्राप्त की और उनमें से 12 द्वितीय श्रेणी में उत्तीर्ण हुए। 1998 में, श्री राजीव सेन गुप्ता ने 764/1000 अंकों के साथ राज्य HSLC परीक्षा में 17वीं रैंक हासिल की और 2016 में, श्री दीपिका गोगोई ने 568/600 अंकों के साथ 18वीं रैंक हासिल की। 2015 तक स्कूल ने एचएसएलसी परीक्षाओं में शत-प्रतिशत का रिकॉर्ड कायम रखा है।